Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms