Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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