Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc171E9Q1U1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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