Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms