Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms