Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms