Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3676D3Z236 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms