Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms