Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms