Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmf1B9EKI3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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