Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Cttnbp2B9EJA2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms