Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia1B2RXQ2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms