Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apba1B2RUJ5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms