Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms