Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrn3B2RS91 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms