Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf518bB2RRE4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf518bB2RRE4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms