Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms