Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms