Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprsB0V2N1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprsB0V2N1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms