Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms