Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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H2-M5A7VMS3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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