Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3173A6NAS3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3173A6NAS3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms