Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms