Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xlr4aA2BI40 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms