Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms