Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34dA2AGU5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms