Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6268A2A3U9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm6268A2A3U9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms