Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1bA1Z198 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrp1bA1Z198 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms