Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIF8

Irgm2, Immunity-related GTPase family M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm2A0A140LIF8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irgm2A0A140LIF8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irgm2A0A140LIF8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms