Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms