Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms