Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trbv30A0A0B4J1P1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trbv30A0A0B4J1P1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trbv30A0A0B4J1P1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv30A0A0B4J1P1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv30A0A0B4J1P1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv30A0A0B4J1P1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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