Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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