Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccdc18Q640L5 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc18Q640L5 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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