Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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