Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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