Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms