Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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NischQ80TM9 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NischQ80TM9 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NischQ80TM9 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
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