Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Q3U6N9 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.1 ms