Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Sh3bp1P55194 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Sh3bp1P55194 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Sh3bp1P55194 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Sh3bp1P55194 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Sh3bp1P55194 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Sh3bp1P55194 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Sh3bp1P55194 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Sh3bp1P55194 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Sh3bp1P55194 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC8.34□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
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