Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mir30c-1-201ENSMUST00000083556 89 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm5120-201ENSMUST00000215231 2414 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm3839-201ENSMUST00000181173 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Hdhd2-208ENSMUST00000148955 3069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Prc1-210ENSMUST00000174172 3008 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Klf6-201ENSMUST00000000080 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Chrdl2-202ENSMUST00000107084 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hoxd9P28357 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hoxd9P28357 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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