Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Brd8-204ENSMUST00000115766 4258 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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