Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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Ccdc71Q8VEG0 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ccdc71Q8VEG0 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ccdc71Q8VEG0 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ccdc71Q8VEG0 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ccdc71Q8VEG0 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ccdc71Q8VEG0 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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