Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Atp7b-201ENSMUST00000006742 6505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ubox5-201ENSMUST00000028761 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr1424-202ENSMUST00000207681 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Garnl3-207ENSMUST00000137381 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 9130015G15Rik-201ENSMUST00000208621 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm9169-201ENSMUST00000182930 536 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms