Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Vps8-203ENSMUST00000115397 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Kctd21-201ENSMUST00000054107 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 4921517D22Rik-201ENSMUST00000061597 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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