Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Vma21-202ENSMUST00000114576 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 2010109I03Rik-201ENSMUST00000077004 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Asph-208ENSMUST00000108334 2685 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm28095-201ENSMUST00000186343 1515 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Mpp1-203ENSMUST00000114092 1378 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Aasdh-202ENSMUST00000120963 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms