Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Siah1bQ06985 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms