Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Trim35Q8C006 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Trim35Q8C006 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gpatch2l-201ENSMUST00000071106 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm36325-201ENSMUST00000210487 2885 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mis18bp1-201ENSMUST00000052201 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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