Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm11346-203ENSMUST00000135889 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm37818-201ENSMUST00000194952 3169 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gimap8-201ENSMUST00000078223 3160 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Dgat2l6-201ENSMUST00000037541 1640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Sat1-202ENSMUST00000112551 896 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Trpc7-201ENSMUST00000022023 3483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Cd99l2-202ENSMUST00000080035 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm35177-201ENSMUST00000216525 623 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm9158-201ENSMUST00000222116 582 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 1700028E10Rik-203ENSMUST00000201142 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Palmd-201ENSMUST00000040097 2433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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