Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Puf60Q3UEB3 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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